Оказывется, сделать это сложно, но можно. Brian Keller приводит подробное описание процедуры в своем блоге:
http://blogs.msdn.com/briankel/archive/2007/04/14/Configuring-Visual-Studio-2005-Team-Foundation-Server-with-Windows-SharePoint-Services-3.0.aspx
Сразу предупрежу, что документация имеет формат Microsoft Word 2007, поэтому пользователям более старых версий MS Office придется установить т.н. compatibility pack.
От себя еще добавлю, что, судя по приведенной информации, есть техническая возможность "сдружить" TFS с уже существующими сайтами на основе WSS 2.0, если оные сайты будут удовлетворять ожиданиям Application Tier'а Team Foundation Server. Это был бы очень полезный фичер для внедрения TFS на текущих проектах, на SharePoint сайтах которых с большой вероятностью уже хранится масса полезной информации.